コマンドプロンプト(cmd)の文字コードは、chcpコマンドを使えば変更可能です。
>chcp
現在の文字コードを表示
>chcp 20932
EUCに変更
>chcp 50220
JISに変更
>chcp 65001
UTF-8に変更
>chcp 932
Shift_Jisに変更(デフォルト)
また、普通に文字コードを変更しただけだと、「フォントが日本語対象外」のため、2バイト文字を表示させると文字化けしちゃいます。
フォントの変更は
http://fine.ap.teacup.com/hepo/30.html
を参考にしてみて下さい。

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